Druhým nejdůležitějším člověkem v diecézi po biskupovi je generální vikář. Zastupuje biskupa například v jednání s úřady, farnostmi a nebo v řízení zaměstnanců. Generálního vikáře musí mít každá diecéze a do funkce jej jmenuje sám biskup.
V naší arcidiecézi máme generální vikáře dva – Mons. Josefa Nuzíka (od 1. července 2009) a Mons. Antonína Baslera (od 1. října 2017); oba jsou zároveň pomocnými biskupy. Mons. Nuzík se stará o ekonomickou a personální oblast a Mons. Basler o chod úřadu arcibiskupství, některé pastorační oblasti a Centrum pro kulturu.